PLUMED

分子动力学增强采样工具包

概述

PLUMED是一个用于分子动力学增强采样的开源工具包。它提供了丰富的集体变量和增强采样方法，可以与多种分子动力学软件（如GROMACS、AMBER、LAMMPS等）集成使用。

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功能特点

  • 丰富的集体变量定义
  • 多种增强采样方法
  • 与主流MD软件集成
  • 自由能计算
  • 路径采样
  • 元动力学
  • 温度副本交换
  • 自定义分析工具

系统要求

基本要求

  • Linux/Unix系统
  • C++编译器
  • CMake 3.0+
  • 4GB RAM

推荐配置

  • 多核CPU
  • 16GB+ RAM
  • 支持MPI
  • 支持OpenMP

文档资源

用户手册

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教程

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快速信息

版本
2.8.0
许可证
LGPL-3.0
类别
分子动力学
最后更新
2024年3月

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